Molecular passportization of clones of karelian birch using PCRwith semi-specific primers

Abstract

Using 4 clones of Karelian birch (Betula pendula Roth var caretica Merckl.) from the collection of the karelian birch of the laboratory of genetics of Research Institute of Forest Genetics and Breeding, Voronezh, one normal tree of Betula pendula Roth, and one tree of B. pubescens Ehrh., collected from the nature, we have analyzed the possibility of application of PCR with semi-specific primers for molecular typing. We found primers with high percentage of polymorphic markers. These primers could be recommended for molecular typing of birch.

Keywords

SEMI- RAPD

References

[1] Баранов О. Ю., 2002. Изучение уровня генетической изменчивости и дифференциации среди форм берез//Проблемы лесоведения и лесоводства: сб. науч. трудов. ин-та леса НАН Беларуси. Вып. 55. Гомель: ИЛ НАН Беларуси. С. 143-147.

[2] Баранов О. Ю., Марковская Ю. А., 2003. Особенности генетической структуры березы карельской по гену Gpi-2//Проблемы лесоведения и лесоводства: сб. науч. трудов. ин-та леса НАН Беларуси. Вып. 50. Гомель: ИЛ НАН Беларуси. С. 181 -185.

[3] Бутова Г. П., Табацкая Т. М., Скробова Л. Л., 1990. Способ микроклонального размножения карельской березы//А. с. N 1597386 AIС N5/00 опубл. 7.10.90. Бюл. № 37.

[4] Ветчинникова Л. В., 2005. Карельская береза и другие редкие представители рода Betula L. М.: Наука, 269 с.

[5] Гостимский С. А., Кркаева 3. Г., Коновалов Ф. А., 2005. Изучение организации и изменчивости генома растений с помощью молекулярных маркеров//Генетика. Т. 41. С. 480-492.

[6] Машкина О. С., Табацкая Т. М., 2005. Рекомендации по сохранению и воспроизводству методами биотехнологии ценных генотипов карельской березы, осины, тополя белого и сереющего. Воронеж: НИИЛГиС,29с.

[7] Машкина О. С., Табацкая Т. М., Стародубцева Л. М., 1999. Длительное микрочеренкование для массового клонального размножения карельской березы и тополя//Физиология растений. Т. 46, С. 950-953.

[8] Самсонова А. Е., Машкина О. С., Исаков Ю. Н., 2001.Эндогенные регуляторы роста иукореняемость различных генотипов карельской березы при микро-клональном размножении//Организация и регуля ция физиолого-биохимических процессов: Сб. науч. тр. Воронеж: ВГУ. С. 97-102.

[9] Терентьев П. В., Ростова Н. С., 1979. Практикум по биометрии. Л.: Из-во ЛГУ, С. 151.

[10] Хлёсткина Е. К., Салина Е.А., 2006. SNP-маркеры: методы анализа, способы разработки и сравнительная характеристика на примере мягкой пшеницы. Генетика. Т. 42, № 6. С. 725-736.

[11] Gomel M., Wisnewska I., Rafalski A., 2002. Semi-specific PCR for the evaluation of diversity among cultivars of wheat and triticale//Cellular and Molecular Biology Tetters. Vol. 7. P. 577-582

[12] Ни J., van Eysden J., Quiros С. Е., 1995. Generation of DNA-based markers in specific genome regions by two-primer RAPD reactions//PCR Methods Appl. Vol. 4. P. 346-351.

[13] Matveeva T V.,LutovaL.A., WoodD.,NesterE. W., 2003. Search for sequences homologous to Agrobacterium T-DNA in different plant genomes//Biology of Plant-Microbe Interactions. Vol. 4. R 526-529

[14] Przetakewicz J., Nadolska-Orczyk A., Orczyk W., 2002.The use of RAPD and semi-random markers to verify somatic hybrids between diploid lines of Solanum tuberosum L.//Cellular and Molecular Biology Letters, Vol. 7. P. 671-676

[15] Van der Peer Y., de Wachter R., 1994. TREECON for Windows: a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment//Comput. Applic. Biosci. Vol. 10, P. 569-570

[16] Welsh J., McClelland., 1991.Genomic fingerprinting genomes using arbitrary primed PCR and matrix of pairwise combinations of primers//NAR. Vol. 19, P. 5275-5279.

[17] Whilliams J. G. K, Kubelik A. R., Livak К. J. el at, 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers.//NAR. Vol. 18, P. 6531-6535.

RIGHTS & PERMISSIONS

Matveeva T.V., Mashkina О.S., Isakov Y.N., Lutova L.A.