DETECTION AND GENETIC CHARACTERISTICS OF RNA ISOLATES OF CRIMEAN-CONGO HAEMORRHAGIC FEVER VIRUS FROM THE HYALOMMA MARGINATUM TICKS COLLECTED IN THE ASTRAKHAN REGION (2016)

Abstract

1,746 specimens of H. marginatum ticks collected in the Astrakhan region were examined by RT-PCR, their infection rate with CCHF virus amounted to 1.5%. This is comparable with results of earlier studies performed in different years in the Astrakhan and Rostov regions and testified to such indices of viral resistance as 0.1; 0.9; 2.4; 0.6; 0.9 and 2.3%. As a result of sequencing of fragments of the genome (fourteen of the 26 isolates of RNA, they refer to the genotype «Europe-1.» Seven out of 14 isolates belong to the subtype Va «Stavropol-Rostov-Astrakhan», two represent the reassortant genetic variant S-Vc; M-Vb; L-Va.

Keywords

CCHF virus / carriage of virus / RT-PCR / genome sequences

References

[1] Зимина Ю.В., Бируля Н.Б., Березин В.В. и соавт. Материалы зоолого-паразитологической характеристики крымской геморрагической лихорадки в Астраханской области. Труды Института полиомиелита и вирусных энцефалитов. М.: 1965; 7: 288-395.

[2] Зимина Ю.В., Куликова Л.Н., Салько В.Н., Ковтунов А.И. Иксодовые клещи в Астраханской области, их роль в формировании природных очагов и передаче арбовирусов человеку. Вопросы риккетсиологии и вирусологии (Сборник научных трудов), Астрахань-Москва: 1996; 58-62.

[3] Бутенко А.М. Крымская-Конго геморрагическая лихорадка. В кн. Эволюция инфекционных болезней в России в XX веке, М.: Медицина; 2003: 365-76.

[4] Путилина Н.Г., Мальков П.М., Куликова Л.Н. и соавт. Детекция РНК вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки в клещах Hyalomma marginatum, снятых с покусанных людей. Вопросы вирусологии, 2012; 3: 37-40.

[5] Топорков А.В., Кабин В.В., Тарасов М.А. и соавт. Организационно-методические аспекты обследования сочетанных очагов особоопасных арбовирусных и бактериальных инфекций (на примере Среднего и Нижнего Поволжья). В сб.: Арбовирусы и арбовирусные инфекции. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции». Астрахань, 17-20 октября 2006 г. М.; 2007: 147-9, Издательство «Гриф и К»

[6] Москвитина Э.А., Водяницкая С.Ю., Ломов Ю.А. и соавт. Современное состояние природного очага крымской геморрагической лихорадки в Ростовской области. В сб.: «Арбовирусы и арбовирусные инфекции. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции», Астрахань, 17-20 октября 2006 г. М.: 2007; 128-32. Издательство «Гриф и К»; Тула.

[7] Серегин С.В., Петрова И.Д., Вышемирский О.И. и соавт. Изучение генетической вариабильности штаммов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, циркулирующих в России и странах Средней Азии. В сб.: Арбовирусы и арбовирусные инфекции. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции», Астрахань, 17-20 октября 2006 г. М.; 2007: 52-6. Издательство «Гриф и К»; Тула.

[8] Карань Л.С., Платонов А.Е., Смирнова С.Е. и соавт. Генетические исследования при Крымской геморрагической лихорадке: от диагностики до молекулярной эпидемиологии. Материалы расширенного пленума проблемной комиссии «Арбовирусы» и научно-практической конференции «Арбовирусы и арбовирусные инфекции», Астрахань, 17-20 октября 2006 г. М.; 2007: 57-61, Издательство «Гриф и К»; Тула.

[9] Volynkina A.S., Kotenov E.S., Lisitskaya V.V. Genetic analysis of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in the South of Russia. 1stInternetional Conference on Crimean-Congo hemorrhagic fever, 13-14 February 2015, Thessaloniki, Greece. Abstracts, 10.

[10] Klimentov A.S., Butenko A.M., Larichev V.F. et al. Genetic diversity of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in Russia. 1stInternetional Conference on Crimean-Congo.

RIGHTS & PERMISSIONS

Eco-vector