SEROTYPING OF STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE STRAINS, ISOLATED FROM CHILDREN IN URAL REGION WITH THE USE OF MULTIPLEX PCR

Abstract

This article presents results of the multiplex PCR investigation of the serotypes distribution of S. pneumoniae strains circulating in Ekaterinburg and the Sverdlovsk region. This study was performed in children with invasive, noninvasive pneumococcal infections and carriers. 118 strains of pneumococci typed out of 129 ones (91.5%) referred to the 15 serotypes: 6A, 6B (20,8%); 23F (13,9%); 19F (11,5%); 8, 9V, 9A, 11F, 11A, 11B, 11C, 11D, 12F, 15A, 33F (11,5%); 3 (10%) 2, 15F, 17F, 22F, 23B (3,9%); 18B, 18C (3.9%), 19A (3,2%); 7F, 19B, 19C, 23A (3,2%); 5,10A (1.6%), 20 (1.6%), 14 (1, 6%); 9L, 9N, 15B, 15C (1,6%); 18F (1,6%); 18A (1.6%). Coincidence rate of serotypes S. pneumoniae, isolated from children with chronic infectious and inflammatory diseases of the lung with serotypes included into the content of the conjugate vaccines is: 7-valent - 69.3%, 10-valent - 98.2%, 11 - and 13-valent - 100%.

Keywords

PCR / serotypes of S. pneumoniae / conjugated vaccines / children

References

[1] Воронина Л.Г., Саматова Е.В., Блинова С.М. и др. Этиологическая значимость микроскопического исследования мокроты у детей с острой и хронической бронхолегочной патологией // Вестн. Урал. мед. акад. науки. - 2011. - Т. 36, № 3. - С. 84-88.

[2] Гольдштейн А.В. Вакцинопрофилактика пневмококковой инфекции. Бюл. «Вакцинация» / Бронхолегоч. забол. - 2004. - № 2. - С. 30-35.

[3] Катосова Л.К., Сидорина Т.М., Батуро А.П. и др. Серотипы Streptococcus pneumoniae у детей, больных хроническими воспалительными заболеваниями органов дыхания // Журн. микробиол. - 1990. - №2. - С. 32-37.

[4] Катосова Л.К., Таточенко В.К., Арова А.А. и др. Серотипы Streptococcus pneumoniae у детей, больных острой пневмонией и плевритом // Журн. микробиол.- 1990. - № 5. - С. 23-28.

[5] Козлов Р.С. Пневмококки: прошлое, настоящее и будущее. -Смоленск, 2005.

[6] 6. Козлов Р.С., Чагарян А.Н., Козлова Л.В. и др. Серологическая характеристика и чувствительность к антибиотикам пневмококков, выделенных у детей в возрасте до 5 лет в отдельных регионах Российской Федерации // Клин. микробиол. и антимикроб. химиотер. - 2011. - Т. 13, №2. - С. 177-187.

[7] Мартынова А.В. Эпидемиологические аспекты пневмококковых инфекций и молекулярно-генетическая характеристика Streptococcus pneumoniae. Автореф. дис.. д-ра мед. наук. - СПб., 2008.

[8] Маянский А.Н. Патогенетическая микробиология. Руководство. - Н. Новгород, 2006.

[9] Маянский Н.А., Алябьева Н.М., Катосова Л.К. и др. Определение капсульных серотипов пневмококка методом мультиплексной ПЦР // Вопр. диагн. в педиатр. - 2010. - Т. 2, № 6. - С. 6-10.

[10] Миронов О.К., Платонов А.Е., Козлов Р.С. Идентификация и се-ротипирование российских штаммов Streptococcus pneumoniae с применением методик, основанных на ПЦР / Клин. микробиол. и антимикроб. химиотер. - 2011. - Т. 13, № 4. - С. 304-313.

[11] МР 3.3.1.0027-11 «Эпидемиология и вакцинопрофилактика инфекции, вызываемой Streptococcus pneumoniae». - М., 2011.

[12] Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях ЛПУ: приказ МЗ СССР №535 от 22.04.85. - М., 1985.

[13] Покровский В.И., Брико Н.И., Ряпис Л.А. Стрептококки и стрептококкозы. - М., 2006.

[14] Рыжов А.А. Вакцины «Pneumo-23» и «Act-HIB» в профилакти ке и лечении хронических заболеваний легких у детей. Дис.. канд. мед. наук. - М., 2004.

[15] Ряпис Л.А., Брико Н.И. Проблема пневмококковых инфекций в России / Эпидемиол. и инфекц. бол. - 2010. № 1. - С. 4-8.

[16] Таточенко В.К. Клинические проявления пневмококковой инфекции в разных возрастных группах // Бюл. «Вакцинация»/ Пневмокок. инфекц. - 2009. - № 2. - С. 3-7.

[17] Таточенко В.К., Катосова Л.К., Уланова М.А. и др. Периодические и географические различия серотипового спектра пневмококков у детей с респираторными заболеваниями и здоровых носителей // Журн. микробиол. 1994. - № 3. - С. 3-10.

[18] Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории: методические указания 4.2.2039-05. М., 2005.

[19] Brito D.A., Ramirez M., Lencastre H. Serotyping Streptococcus pneumoniae by Multiplex PCR // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, N 6. - P. 2378-2384.

[20] Centers for Disease Control and Prevention. Epidemiology and Prevention of Vaccine-Preventable Diseases. 7 th ed. - Atlanta, 2002. - P. 205-217.

[21] Centers for disease control and prevention. PCR Deduction of Pneumococcal Serotypes, October 2009. Serotype distribution of invasive pneumococcal disease isolates among children № 5 years of age, Active Bacterial Core surveillance areas, 2008 vs. 1998-1999. Available at: http://www.cdc.gov/ncidod/biotech/strep/pcr.htm.

[22] Centers for disease control and prevention. PCR Deduction of Pneumococcal Serotypes, June 2011. Serotype-specific IPD in children № 5yrs during 2005-2009, Active Bacterial Core surveillance data. Available at: http://www.cdc.gov/ncidod/biotech/strep/pcr.htm.

[23] Chang C.C., Singleton R.J., Morris P.S. et al. Pneumococcal vaccines for children and adults with bronchiectasis // Cochrane Database Syst. Rev. - 2009. - Vol. 15, N 2. - CD006316.

[24] Mackenzie G.A., Leach A.J., Carapetis J.R. et al. Epidemiology of nasopharyngeal carriage of respiratory bacterial pathogens in children and adults: cross-sectional surveys in population with high rates of pneumococcal disease // BMC Infect. Dis. - 2010. - Vol. 10. - P. 304-314.

[25] Prevention of pneumococcal diseases among infants and young children using a pneumococcal conjugate vaccine. Recommendations of the Advisory Committee on Immunization Practices (ACIP) // Mor-biol. Mortal. Wkly Rep. - 2000. -Vol. 49, RR09. - P. 1-38.

[26] Robinson K.A., Baughman W., Rothrock G. et al. Epidemiology of invasive Streptococcus pneumoniae infections in the United States, 1995-1998. Opportunities for prevention in the conjugate vaccine era // J. A. M. A. - 2001. - Vol. 285. - P. 1729-1735.

[27] Zangwill K.M., Vadheim C.M., Vannier A.M. et al. Epidemiology of invasive pneumococcal disease in Southern California: implications for design and conduct of a pneumococcal conjugative vaccine trial // J. Infect. Dis. - 1996. - Vol. 174. - P. 752-759.

RIGHTS & PERMISSIONS

Eco-vector