Estimation of serological landscape of nazofaringeal strains of Streptococcus pneumoniae circulating in the territory of Barnaul

Abstract

Aim. To study the prevalence of S. pneumoniae serotypes in nasopharyngeal carriage among different age groups in organized groups to optimize the information and analytical system of epidemiological surveillance of pneumococcal infection.

Methods. By classical bacteriological method 75 nasopharyngeal isolates of pneumococcus, which later were serotyped, were identified in 319 subjects of different age from children's and adults' organized groups in Barnaul.

Results. In 2017 the epidemiological screening was used to evaluate the prevalence of S. pneumoniae carriage. After identification, nasopharyngeal pneumococcal strains underwent serotyping. The greatest proportion of serological landscape of the studied strains was 3 and 19F serotypes, the total proportion of which was 75±9.7%. 13-valent pneumococcal conjugated vaccine had the maximum coverage of local strains - 62.5%. Based on the data on community-acquired pneumonia caused most often by pneumococcus, from information and analytical system received from the territories of the region, the database «Community-acquired pneumonia of the Altai Krai» was created. However, for an adequate assessment of the epidemiological situation regarding pneumococcal infection in the region, incoming information was not enough. The analysis of information from the territories on community-acquired pneumonia allowed identifying disadvantages of epidemiological surveillance of this nosology and inability to adequately assess the epidemiological situation with regard to pneumococcal infection in the region.

Conclusion. The results of serotyping allowed determining further tactics of immunization in the Altai Krai; information and analytical system requires supplementing microbiological monitoring data regarding antibiotic susceptibility and resistance to disinfectants of the etiological agent.

Keywords

pneumococcal infection / serotypes / epidemiological surveillance

References

[1] Nikolenko V.V., Feldblyum I.V., Golodnova S.O., Vorob'eva N.N. Medical workers as risk group concerning pneumococcal infection. Meditsinskiy a'lmanakh. 2014; (4): 30–34. (In Russ.)

[2] Николенко В.В., Фельдблюм И.В., Голоднова С.О., Воробьёва Н.Н. Медицинские работники как группа риска по пневмококковой инфекции. Мед. альманах. 2014; (4): 30-34.

[3] Baranov A.A., Briko N.I., Namazova-Baranova L.S. Modern clinical and epidemiological characteristics of pneumococcal infections. Lechahschiy Vrach. 2012; (4): 79–82. (In Russ.)

[4] Баранов А.А., Брико Н.И., Намазова-Баранова Л.С. Современная клинико-эпидемиологическая характеристика пневмококковых инфекций. Леч. врач. 2012; (4): 79-82.

[5] Sanitary-epidemiological Regulations ussied on 2.02.2014 SP 2.1.2.3116-13 «Prevention of community-acquired pneumonia». (In Russ.)

[6] Санитарно-эпидемиологические правила от 2.02.2014 СП 2.1.2.3116-13 «Профилактика внебольничных пневмоний».

[7] Briko N.I., Nazarova-Bazarova L.S., Kostinov M.P. et al. Epidemiologiya, klinika i profilaktika pnevmokokkovoy infektsii. Mezhdistsiplinarnoe uchebnoe posobie dlya vrachey. (Epidemiology, clinic and prevention of pneumococcal infection. Interdisciplinary manual for doctors.) Moscow: Remedium Privolzhye. 2017; 112 р. (In Russ.)

[8] Брико Н.И., Назарова-Базарова Л.С., Костинов М.П. и др. Эпидемиология, клиника и профилактика пневмококковой инфекции. Междисциплинарное учебное пособие для врачей. М.: Ремедиум Приволжье. 2017; 112 с.

[9] Tatochenko V.K. Bolezni organov dykhaniya u detey. Prakticheskoe rukovodstvo. (Diseases of the respiratory system in children. A practical guide.) Moscow: Pediatr. 2012; 479 р. (In Russ.)

[10] Таточенко В.К. Болезни органов дыхания у детей. Практическое руководство. М.: ПедиатрЪ. 2012; 479 с.

[11] Kosenko I.M. Antibiotic therapy of community-acquired respiratory and ENT-infections: new potentials for overcoming resistance. Farmateka. 2011; (18): 15–20. (In Russ.)

[12] Косенко И.М. Антибактериальная терапия внебольничных респираторных и ЛОР-инфекций: новые возможности в преодолении резистентности. Фарматека. 2011; (18): 15-20.

[13] Mayanskiy N.A., Alyabyeva N.M., Lazareva M.A. et al. Sensitivity to antibiotics, clonal and serotypic variety of pneumococci in children with acute otitis media in Moscow. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2016; 18 (2): 84–92. (In Russ.)

[14] Маянский Н.А., Алябьева Н.М., Лазарева М.А. и др. Чувствительность к антибиотикам, клональное и серотиповое разнообразие пневмококков у детей с острым средним отитом в г. Москве. Клин. микробиол. и антимикробная химиотерап. 2016; 18 (2): 84-92.

[15] Yakovlev S.V., Sidorenko S.V., Rafal'skiy V.V., Spichak T.V. Strategiya i taktika ratsional'nogo primeneniya antimikrobnykh sredstv v ambulatornoy praktike. Rossiyskie prakticheskie rekomendatsii. (Strategy and tactics of rational use of antimicrobial agents in outpatient practice. Russian practical recommendations.) Moscow: Presto. 2014; 121 р. (In Russ.)

[16] Яковлев С.В., Сидоренко С.В., Рафальский В.В., Спичак Т.В. Стратегия и тактика рационального применения антимикробных средств в амбулаторной практике. Российские практические рекомендации. M.: Престо. 2014; 121 с.

[17] Tatochenko V.K., Bakradze M.D., Khokhlova T.A., Rogova O.A. Rational antibacterial therapy of respiratory tract infections. Meditsinskiy sovet. http://www.remedium.ru/pda/doctor/detail.php?ID=65131 (access date: 31.03.2018). (In Russ.)

[18] Таточенко В.К., Бакрадзе М.Д., Хохлова Т.А., Рогова О.А. Рациональная антибактериальная терапия инфекций дыхательных путей. Мед. совет. http://www.remedium.ru/pda/doctor/detail.php?ID=65131 (дата обращения: 31.03.2018).

[19] Boronina L.G., Samatova E.V., Blinova S.М. Changes in antimicrobial resistance in clinical pediatric isolates of Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, and Moraxella catarrhalis in Middle Ural area. Klinicheskaya mikrobiologiya i antimikrobnaya khimioterapiya. 2017; 19 (2): 51–58. (In Russ.)

[20] Боронина Л.Г., Саматова Е.В., Блинова С.М. Динамика формирования антибиотикорезистентности у Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Moraxella catarrhalis, вызывающих ЛОР-патологию и внебольничные бронхолёгочные заболевания у детей на Среднем Урале. Клин. микробиол. и антимикробная химиотерап. 2017; 19 (2): 51-58.

[21] Pai R., Gertz R.E., Beall B. Sequental multiplex PCR approach determining capsular serotypes of Streptococcus pneumoniae isolates. J. Clin. Microbiol. 2006; 44: 124–131. DOI: 10.1128/JCM.44.1.124-131.2006.

[22] Pai R., Gertz R.E., Beall B. Sequental multiplex PCR approach determining capsular serotypes of Streptococcus pneumoniae isolates. J. Clin. Microbiol. 2006; 44: 124-131. DOI: 10.1128/JCM.44.1.124-131.2006.

[23] Sidorenko S.V., Savinova T.A., Il'ina E.N., Syrochkina M.A. Population structure of pneumococci with reduced sensitivity to penicillin and prospects of antipneumococcal vaccination to contain the spread of antibacterial resistance. Antibiotiki i khimioterapiya. 2011; 56 (5–6): 11–18. (In Russ.)

[24] Сидоренко С.В., Савинова Т.А., Ильина Е.Н., Сырочкина М.А. Популяционная структура пневмококков со сниженной чувствительностью к пенициллину и перспективы антипневмококковой вакцинации для сдерживания распространения антибактериальной резистентности. Антибиотики и химиотерапия. 2011; 56 (5-6): 11-18.

[25] Briko N.I. The burden of pneumococcal infections and the directions of improving epidemiological surveillance in Russia. Epidemiologiya i infektsionnye bolezni. Aktual'nye voprosy. 2013; (6): 4–9. (In Russ.)

[26] Брико Н.И. Бремя пневмококковых инфекций и направления совершенствования эпидемиологического надзора в России. Эпидемиол. и инфекц. бол. Актуальные вопросы. 2013; (6): 4-9.

[27] Briko N.I. Prevalence and possibilities of preventing pneumococcal infections in the world and in Russia. Vaktsinasiya. 2009; (2): 5–7. (In Russ.)

[28] Брико Н.И. Распространённость и возможности профилактики пневмококковых инфекций в мире и в России. Вакцинация. 2009; (2): 5-7.

[29] Epidemiologicheskiy nadzor za vnebol'nichnymi pnevmoniyami. (Epidemiological surveillance of community-acquired pneumonia.) Methodological Instructions MU 3.1.2.3047-13 (approved and put into effect by the Chief State Sanitary Doctor of the Russian Federation on January 10, 2013). http://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70194836 (access date: 02.04.2018). (In Russ.)

[30] Эпидемиологический надзор за внебольничными пневмониями. Методические указания МУ 3.1.2.3047-13 (утв. и введ. в действие Главным государственным санитарным врачом РФ 10 января 2013 г.). http://www.garant.ru/products/ipo/prime/doc/70194836 (дата обращения: 02.04.2018).

[31] Ryapis L.A., Briko N.I. Epidemiological surveillance and tactics of specific prevention of invasive pneumococcal infections in Russia. Zhurnal mikrobiologii. 2009; (6): 112–118. (In Russ.)

[32] Ряпис Л.А., Брико Н.И. Эпидемиологический надзор и тактика специфической профилактики инвазивных пневмококковых инфекций в России. Ж. микробиологии. 2009; (6): 112-118.

RIGHTS & PERMISSIONS

Kozyanova Y.A., Safyanova T.V.